Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-8■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.141e-8■■■■□ 21.9
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TARDBPQ13148 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.374e-8■■■■□ 21.7
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TARDBPQ13148 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.194e-8■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.044e-8■■■■□ 21.7
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TARDBPQ13148 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.425e-9■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ZKSCAN3-201ENST00000252211 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.535e-9■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 ZKSCAN3-202ENST00000341464 1794 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.025e-9■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 48.28□□□□□ -1.085e-9■■■■□ 21.7
TARDBPQ13148 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.444e-6■■■■□ 21.7
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