Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MRPL28Q13084 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms