Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYP4A11Q02928 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYP4A11Q02928 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms