Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM3AP98173 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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