Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERFP50548 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERFP50548 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERFP50548 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERFP50548 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERFP50548 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERFP50548 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERFP50548 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERFP50548 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ERFP50548 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ERFP50548 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms