Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD34P28906 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD34P28906 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CD34P28906 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD34P28906 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD34P28906 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms