Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATF1P18846 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATF1P18846 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF1P18846 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF1P18846 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATF1P18846 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATF1P18846 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF1P18846 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF1P18846 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF1P18846 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATF1P18846 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms