Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXB9P17482 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXB9P17482 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms