Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SEC24DO94855 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SEC24DO94855 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms