Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL19A1-205ENST00000620364 6233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TUBB-205ENST00000327892 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPK-201ENST00000351839 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLG1-205ENST00000392382 2690 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX1T1-203ENST00000396218 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAPLN-208ENST00000555445 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF750-201ENST00000269394 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHF21A-202ENST00000418153 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTI2-206ENST00000613904 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMT-236ENST00000636597 1509 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PWAR5-201ENST00000624480 3180 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAB21L3-201ENST00000369500 3229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 JADE1-211ENST00000512960 3000 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJB13-205ENST00000543947 1779 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02181-201ENST00000430050 4083 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSDC1-206ENST00000455895 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRAMEF7-201ENST00000330881 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRK2-202ENST00000343742 4740 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASS1-201ENST00000352480 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 IQCK-202ENST00000320394 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASGEF1B-213ENST00000613784 3485 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01266-201ENST00000420823 3948 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00485-201ENST00000547179 3722 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 LUCAT1-203ENST00000513626 2672 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF12-201ENST00000439206 1831 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAB1-205ENST00000371236 5298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAIAP3-215ENST00000568887 3763 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNNA2-201ENST00000343114 2927 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABLIM1-203ENST00000369253 2255 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms