Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC36A3-201ENST00000335230 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2A1-202ENST00000641044 4632 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 IPO5P1-201ENST00000593576 2887 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT1-204ENST00000409465 3097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CAST-206ENST00000395812 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RPL15-210ENST00000456530 2835 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DPF3-203ENST00000541685 4077 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ABLIM3-205ENST00000504238 2774 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NRF1-203ENST00000353868 3568 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GRIA3-204ENST00000541091 2740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ZDHHC21-201ENST00000380916 9160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT1-201ENST00000361099 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC027045.3-201ENST00000635215 2884 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00870-202ENST00000473713 2693 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 DDB2-201ENST00000256996 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL390728.2-201ENST00000400933 1670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GGNBP1-201ENST00000374458 960 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 GYG2P1-203ENST00000382965 149 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AL133406.1-201ENST00000404904 747 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01871-201ENST00000417930 243 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
KRTAP4-2Q9BYR5 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms