RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
LRRTM4-201ENST00000409088 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.76□□□□□ -0.69
LRRTM4-201ENST00000409088 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXD1Q16676 465 aa8.74□□□□□ -1.01
LRRTM4-201ENST00000409088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.66□□□□□ -1.02
LRRTM4-201ENST00000409088 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.63□□□□□ -1.03
LRRTM4-201ENST00000409088 MSH5O43196 834 aa8.35□□□□□ -1.07
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP6R1Q9UPN7 881 aa8.14□□□□□ -1.11
LRRTM4-201ENST00000409088 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LRRTM4-201ENST00000409088 ADRA2BP18089 450 aa8.07□□□□□ -1.12
LRRTM4-201ENST00000409088 POTEDQ86YR6 584 aa7.74□□□□□ -1.17
LRRTM4-201ENST00000409088 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
LRRTM4-201ENST00000409088 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.64□□□□□ -1.19
LRRTM4-201ENST00000409088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.57□□□□□ -1.2
LRRTM4-201ENST00000409088 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.49□□□□□ -1.21
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
LRRTM4-201ENST00000409088 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.46□□□□□ -1.22
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa7.42□□□□□ -1.22
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
LRRTM4-201ENST00000409088 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
LRRTM4-201ENST00000409088 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-201ENST00000409088 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-201ENST00000409088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.26□□□□□ -1.25
LRRTM4-201ENST00000409088 NPM3O75607 178 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.1□□□□□ -1.27
LRRTM4-201ENST00000409088 RNF39Q9H2S5 420 aa7.07□□□□□ -1.28
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC9O60706 1549 aa7.07□□□□□ -1.28
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNA4P22459 653 aa7.07□□□□□ -1.28
LRRTM4-201ENST00000409088 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.97□□□□□ -1.29
LRRTM4-201ENST00000409088 SCRIBQ14160 1630 aa6.94□□□□□ -1.3
LRRTM4-201ENST00000409088 NACADO15069 1562 aa6.93□□□□□ -1.3
LRRTM4-201ENST00000409088 APLP2Q06481 763 aa6.87□□□□□ -1.31
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LRRTM4-201ENST00000409088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.86□□□□□ -1.31
LRRTM4-201ENST00000409088 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.82□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.8□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC4A2P04920 1241 aa6.77□□□□□ -1.32
LRRTM4-201ENST00000409088 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 CECR2Q9BXF3 1484 aa6.76□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.72□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 MROH2BQ7Z745 1585 aa6.71□□□□□ -1.33
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.7□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.68□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 WIZO95785 1651 aa6.66□□□□□ -1.34
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCA4P51532 1647 aa6.62□□□□□ -1.35
LRRTM4-201ENST00000409088 DSG3P32926 999 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM41Q8WV44 630 aa6.59□□□□□ -1.35
LRRTM4-201ENST00000409088 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LRRTM4-201ENST00000409088 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.55□□□□□ -1.36
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB22O15209 634 aa6.54□□□□□ -1.36
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.36
LRRTM4-201ENST00000409088 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 SMARCA2P51531 1590 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.5□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.47□□□□□ -1.37
LRRTM4-201ENST00000409088 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LRRTM4-201ENST00000409088 ABCC8Q09428 1581 aa6.45□□□□□ -1.38
LRRTM4-201ENST00000409088 CAPN15O75808 1086 aa6.44□□□□□ -1.38
LRRTM4-201ENST00000409088 NCAPD3P42695 1498 aa6.43□□□□□ -1.38
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGXB3Q12766 1538 aa6.39□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 SOGA1O94964 1423 aa6.37□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.35□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa6.35□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa6.34□□□□□ -1.39
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNJ1O43426 1573 aa6.33□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 CFTRP13569 1480 aa6.32□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 EEA1Q15075 1411 aa6.31□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.3□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 TRHP20396 242 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 AKT1S1Q96B36 256 aa6.29□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
LRRTM4-201ENST00000409088 TOP2BQ02880 1626 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 POLA2Q14181 598 aa6.27□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 PROM2Q8N271 834 aa6.26□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 CUX1P39880 1505 aa6.26□□□□□ -1.41
LRRTM4-201ENST00000409088 TNIKQ9UKE5 1360 aa6.26□□□□□ -1.41
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