Protein–RNA interactions for Protein: Q96S21

RAB40C, Ras-related protein Rab-40C, humanhuman

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40CQ96S21 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RAB40CQ96S21 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB40CQ96S21 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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