Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTP1Q6DN14 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms