Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNCBQ16143 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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