Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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NEDD8Q15843 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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NEDD8Q15843 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NEDD8Q15843 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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