Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EXOSC2Q13868 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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