Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 COA3-202ENST00000586680 1374 ntTSL 222.78■■□□□ 1.243e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 COA3-201ENST00000328434 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.323e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CDC34-203ENST00000586788 900 ntTSL 229.52■■■□□ 2.323e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.243e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.743e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.683e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.043e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RAE1-208ENST00000492498 1156 ntTSL 520.06■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CAPG-210ENST00000453973 452 ntTSL 318.07■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ANKRD54-210ENST00000498417 2403 ntTSL 217.17■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SERPINF1-208ENST00000572517 672 ntTSL 213.95□□□□□ -0.183e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 DBNDD1-207ENST00000623401 2889 nt13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.372e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.492e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SMC3-201ENST00000361804 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 HNRNPR-206ENST00000464516 557 ntTSL 29.47□□□□□ -0.893e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 SEC22C-211ENST00000451653 5955 ntTSL 1 (best)9.14□□□□□ -0.953e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.981e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 AC099811.2-202ENST00000592248 694 ntTSL 311.73□□□□□ -0.531e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 AC099811.2-201ENST00000585562 646 ntTSL 310.77□□□□□ -0.691e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.644e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 BTBD2-210ENST00000592895 2763 ntTSL 220.65■□□□□ 0.94e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 BTBD2-207ENST00000589685 2422 ntTSL 1 (best)20.31■□□□□ 0.844e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-8■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.151e-8■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 MDH2-201ENST00000315758 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-8■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 ECE2-204ENST00000402825 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)21.27■■□□□ 13e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 219.68■□□□□ 0.743e-7■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.122e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 USP11-206ENST00000469080 3467 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.232e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 USP11-201ENST00000218348 3338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-9■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 223.49■■□□□ 1.357e-31■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 528.21■■■□□ 2.112e-11■■■■□ 21.4
PABPC4Q13310 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.528e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.168e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 FADS2-213ENST00000523235 5073 ntTSL 215.52■□□□□ 0.088e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.021e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.111e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.133e-71■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-71■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.133e-71■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 311.66□□□□□ -0.543e-71■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 211.66□□□□□ -0.543e-71■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.529e-10■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 QPRT-201ENST00000219771 913 ntTSL 221.88■■□□□ 1.094e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.744e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 QPRT-204ENST00000564967 2199 nt14.54□□□□□ -0.084e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.846e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPS18B-206ENST00000259873 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.469e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPS18B-208ENST00000472267 1610 ntTSL 1 (best)12.09□□□□□ -0.479e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPS18B-207ENST00000472229 1409 ntTSL 311.09□□□□□ -0.639e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.754e-11■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 AP1S1-203ENST00000443943 741 ntTSL 325.43■■□□□ 1.664e-11■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-12■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 CCDC142-203ENST00000454193 2309 ntTSL 221.38■■□□□ 1.012e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPL53-203ENST00000467349 451 ntTSL 219.32■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MRPL53-204ENST00000468875 574 ntTSL 218.2■□□□□ 0.52e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-216ENST00000601340 2197 ntTSL 219.66■□□□□ 0.741e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-205ENST00000596477 865 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-209ENST00000598820 2615 ntTSL 215.98■□□□□ 0.151e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-214ENST00000601015 697 ntTSL 515.72■□□□□ 0.111e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-13■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 COG4-213ENST00000565715 575 ntTSL 211.35□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 SEH1L-210ENST00000592582 4072 ntTSL 1 (best)6.34□□□□□ -1.49e-54■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 PIN1-203ENST00000585442 705 ntTSL 519.55■□□□□ 0.721e-7■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MPDU1-206ENST00000571391 677 ntTSL 213.37□□□□□ -0.276e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MPDU1-219ENST00000580708 563 ntTSL 59.79□□□□□ -0.846e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 MPDU1-213ENST00000575256 392 ntTSL 35.99□□□□□ -1.456e-6■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.589e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.969e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.999e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.672e-8■■■■□ 21.3
PABPC4Q13310 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.011e-14■■■■□ 21.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 296.6 ms