RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEH1L-210ENST00000592582 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SEH1L-210ENST00000592582 EHMT2Q96KQ7 1210 aa11.11□□□□□ -0.63
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SEH1L-210ENST00000592582 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
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SEH1L-210ENST00000592582 SLC24A1O60721 1099 aa9.8□□□□□ -0.84
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SEH1L-210ENST00000592582 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.46□□□□□ -0.89
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SEH1L-210ENST00000592582 SMARCA4P51532 1647 aa9.44□□□□□ -0.9
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SEH1L-210ENST00000592582 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
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SEH1L-210ENST00000592582 SMARCA2P51531 1590 aa9.35□□□□□ -0.91
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SEH1L-210ENST00000592582 KIF21BO75037 1637 aa9.16□□□□□ -0.94
SEH1L-210ENST00000592582 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SEH1L-210ENST00000592582 HMGXB3Q12766 1538 aa9.15□□□□□ -0.94
SEH1L-210ENST00000592582 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa9.15□□□□□ -0.95
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SEH1L-210ENST00000592582 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.11□□□□□ -0.95
SEH1L-210ENST00000592582 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
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SEH1L-210ENST00000592582 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SEH1L-210ENST00000592582 SYNJ1O43426 1573 aa9.04□□□□□ -0.96
SEH1L-210ENST00000592582 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SEH1L-210ENST00000592582 EEA1Q15075 1411 aa9.02□□□□□ -0.97
SEH1L-210ENST00000592582 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.01□□□□□ -0.97
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SEH1L-210ENST00000592582 WDR97A6NE52 1622 aa8.99□□□□□ -0.97
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SEH1L-210ENST00000592582 NCAPD3P42695 1498 aa8.94□□□□□ -0.98
SEH1L-210ENST00000592582 NEUROD1Q13562 356 aa8.91□□□□□ -0.98
SEH1L-210ENST00000592582 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
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SEH1L-210ENST00000592582 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.84□□□□□ -0.99
SEH1L-210ENST00000592582 APLP2Q06481 763 aa8.84□□□□□ -0.99
SEH1L-210ENST00000592582 CFTRP13569 1480 aa8.83□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 PRXQ9BXM0 1461 aa8.83□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.82□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 CUX1P39880 1505 aa8.82□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 MAP3K1Q13233 1512 aa8.82□□□□□ -1
SEH1L-210ENST00000592582 CUX2O14529 1486 aa8.81□□□□□ -1
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