Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEFA5Q01523 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA5Q01523 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms