Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MYF6P23409 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MYF6P23409 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MYF6P23409 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MYF6P23409 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms