Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRGAP3O43295 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRGAP3O43295 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms