Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBFOX3A6NFN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms