Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
KLHL13Q9P2N7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL13Q9P2N7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms