Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NKIRAS2Q9NYR9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NKIRAS2Q9NYR9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms