Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC32Q9BV29 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC32Q9BV29 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms