Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STAMBPL1Q96FJ0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
STAMBPL1Q96FJ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms