Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC107Q8WV48 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms