Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATL2Q8NHH9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATL2Q8NHH9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms