Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00303Q3SY05 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms