Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPRRQ15256 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRRQ15256 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms