Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LSAMPQ13449 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LSAMPQ13449 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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