Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CUBNO60494 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms