Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYT7O43581 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYT7O43581 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT7O43581 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT7O43581 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT7O43581 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT7O43581 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYT7O43581 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYT7O43581 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SYT7O43581 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms