Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCER2I3L3R5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCER2I3L3R5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms