Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF879B4DU55 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms