Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GNEQ9Y223 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GNEQ9Y223 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms