Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA9Q9UGM1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRNA9Q9UGM1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms