Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IFIH1Q9BYX4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFIH1Q9BYX4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms