Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ZNF248Q8NDW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF248Q8NDW4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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