Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPP4R4Q6NUP7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms