Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SF3B3Q15393 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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