Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP1Q12981 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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BNIP1Q12981 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNIP1Q12981 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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