Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRATP43155 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRATP43155 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRATP43155 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRATP43155 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms