Protein–RNA interactions for Protein: P0C879

Putative uncharacterized protein FLJ43185, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C879 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P0C879 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P0C879 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P0C879 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P0C879 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P0C879 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0C879 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P0C879 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms