Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CTIFO43310 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CTIFO43310 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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