Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BECN2A8MW95 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BECN2A8MW95 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms