Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
BECN2A8MW95 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
BECN2A8MW95 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
BECN2A8MW95 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
BECN2A8MW95 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
BECN2A8MW95 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
BECN2A8MW95 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
BECN2A8MW95 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
BECN2A8MW95 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BECN2A8MW95 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BECN2A8MW95 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BECN2A8MW95 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
BECN2A8MW95 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BECN2A8MW95 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BECN2A8MW95 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BECN2A8MW95 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BECN2A8MW95 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
BECN2A8MW95 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
BECN2A8MW95 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
BECN2A8MW95 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
BECN2A8MW95 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
BECN2A8MW95 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BECN2A8MW95 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BECN2A8MW95 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BECN2A8MW95 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
BECN2A8MW95 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
BECN2A8MW95 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
BECN2A8MW95 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BECN2A8MW95 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BECN2A8MW95 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BECN2A8MW95 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
BECN2A8MW95 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
BECN2A8MW95 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
BECN2A8MW95 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
BECN2A8MW95 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
BECN2A8MW95 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
BECN2A8MW95 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
BECN2A8MW95 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
BECN2A8MW95 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BECN2A8MW95 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BECN2A8MW95 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BECN2A8MW95 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BECN2A8MW95 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BECN2A8MW95 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
BECN2A8MW95 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
BECN2A8MW95 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
BECN2A8MW95 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BECN2A8MW95 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
BECN2A8MW95 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
BECN2A8MW95 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
BECN2A8MW95 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
BECN2A8MW95 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BECN2A8MW95 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
BECN2A8MW95 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BECN2A8MW95 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BECN2A8MW95 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BECN2A8MW95 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BECN2A8MW95 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BECN2A8MW95 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
BECN2A8MW95 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BECN2A8MW95 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
BECN2A8MW95 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BECN2A8MW95 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BECN2A8MW95 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BECN2A8MW95 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BECN2A8MW95 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BECN2A8MW95 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
BECN2A8MW95 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
BECN2A8MW95 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
BECN2A8MW95 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
BECN2A8MW95 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
BECN2A8MW95 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
BECN2A8MW95 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
BECN2A8MW95 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
BECN2A8MW95 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
BECN2A8MW95 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
BECN2A8MW95 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BECN2A8MW95 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
BECN2A8MW95 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
BECN2A8MW95 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BECN2A8MW95 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BECN2A8MW95 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
BECN2A8MW95 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
BECN2A8MW95 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BECN2A8MW95 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BECN2A8MW95 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BECN2A8MW95 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN2A8MW95 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BECN2A8MW95 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms