Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS37CA5D8V6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VPS37CA5D8V6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms