Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYP26B1-202ENST00000412253 4025 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRPF4-201ENST00000374198 2787 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 IMPDH1P11-201ENST00000567885 1504 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 MS4A15-202ENST00000405633 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL050303.4-201ENST00000624520 1839 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2IP7-201ENST00000434037 2399 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV3-201ENST00000301365 3235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 LAMP5-201ENST00000246070 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NFIA-203ENST00000371185 1714 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAMD4B-214ENST00000611159 3662 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GMPR2-203ENST00000399440 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF683-202ENST00000403843 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARD6G-AS1-202ENST00000586421 3333 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC011337.1-201ENST00000606930 3317 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GINS3-202ENST00000328514 1932 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH5-201ENST00000341529 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC22A8-205ENST00000535878 1387 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF170-203ENST00000319104 1866 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 POLL-201ENST00000299206 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLT4-202ENST00000393347 4292 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF3-203ENST00000342104 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 LHFPL5-201ENST00000360215 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUNX1T1-202ENST00000360348 2370 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 NONO-202ENST00000373841 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATG4C-203ENST00000371120 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
KRTAP9-4Q9BYQ2 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.3 ms